comparaison séquences ADN codant pour xpc

Nature des différences entre allèles (par rapport à l'allèle de référence xpf_0.cod)

Position des différences entre allèles (Pa)

Nature des différences entre protéines (par rapport à la référence pro_xpfnorm.pro)

Position des différences entre protéines (Pp)

Rapport Pa/Pp

Comparaison entre elles des séquences du gène issu du Chromosome 3 d'individus sain et malades : mise en relation avec les séquences protéiques correspondantes.

Comparaison des allèles : cas du gène xpc

Protocole de l'activité :
Lancer le logiciel Anagène
Fichier Ouvrir
Choisir le fichier convenable (séquences de différents allèles du gène : xpc_adn.edi)
Sélectionner la forme de référence et la ou les formes à comparer entre elles.
Traiter Comparer les séquences
Choisir Comparaison simple

Reporter la nature et les positions des différences dans un tableau.

Dans l'allèle xpc_3, on note la ..................................... de deux nucléotides consécutifs (........)

Pour l'allèle xpc_2, on note un triplet .................................... (............) par rapport aux autres allèles

Pour l'allèle xpc_1, on note une seule ..................................... en position ................ (....... au lieu de .........)

	xpc_1	xpc_2	xpc_3
Nature des différences entre allèles (par rapport à l'allèle de référence xpc_0.cod)
Position des différences entre allèles (Pa)
Nature des différences entre protéines (par rapport à la référence pro_xpcnorm.pro)
Position des différences entre protéines (Pp)
Rapport Pa/Pp

Cas du gène xpf (localisé sur le chr 16) :

Remarque : la même démarche peut être menée avec la protéine pro_xpa.